茯苓是一种干燥的多孔菌科真菌菌核。而云苓则是一种干燥的百合科植物光叶菝葜的根茎。它们在性状上有所不同：市场上常见的茯苓经过去皮后，会被切制成立方块状或方块状厚片，颜色为白色、淡红色或淡棕色，粉末呈灰白色；而云苓呈圆柱形，表面有黄棕色或灰褐色，在触摸时有凹凸不平的感觉，质地坚硬。在菜市场上常见的是去皮的新鲜云苓，或者刮皮切片的云苓片。药材市场、药店或医院药房里常见的是切片后干燥的云苓片，切面呈类白色至淡红棕色，在折断时会有粉尘飞扬，在用水湿润后会有粘滑感，粉末颜色为淡棕色。
两者的口感也不同：茯苓的味道淡，咀嚼起来会有些粘牙的感觉；而云苓的味道微甘且稍微带苦。
功效方面也有差异：茯苓的性味为甘淡平，归属于心、肺、脾、肾经。它具有利水渗湿、健脾和宁心的功效，主要用于治疗水肿、尿少、痰饮、眩晕、心神不安、惊悸和失眠等症状。而云苓的性味为平和甘淡，归属于肝、胃经。它有解毒、除湿和通利关节的作用，主要用于治疗梅毒、汞中毒引起的肢体拘挛、筋骨疼痛，以及湿热淋浊、痈肿、瘰疬、疥癣等症状。
