柠檬树修剪包括多种手法，如摘心、短截、疏枝、回缩、扭梢、抹芽、锯主枝和断根。摘心是指在柠檬生长季节剪除新枝的顶端，短截是将一年或多年生的枝条剪短，疏枝是从基部剪除某些枝条，回缩是剪除多年生枝条的先端使其回缩，扭梢是将柠檬的枝条扭曲或向下扭转，抹芽是在夏秋季节将嫩芽抹掉，锯主枝是从基部锯除扰乱树形的大枝，断根是部分切除大根和侧根。
修剪柠檬树的时间可以在一年的任何季节进行，但每个季节的方法和目的会有所不同。生长停滞期如冬季可以进行修剪，在高温地区可在果期之后修剪时清理枯叶和病叶，而在低温地区则可延迟到春季进行修剪。在生长期间如夏季和花期可进行修剪，夏季修剪主要包括抹芽、摘心和短截，以控制枝条生长并促进果实发育。花期的修剪主要是剪除不长叶子的花枝，以减少养分消耗。在生长期修剪后需要消毒，以避免引发病虫害问题。
