花毛茛患上白绢病时，主要是因为植株通风条件不好，土壤养分较低，并且感染了染病菌。病株初期会在茎基部产生淡褐色不规则的水渍状病斑，随后在病部产生白色绢状菌丝，逐渐变成菜籽状菌核。为了预防和治疗这种病害，应加强管理，注意通风透光，适当控制浇水，避免土壤过湿。同时，应定期翻盆换土，避免土壤板结。一旦发现病株，应立即拔除并对土壤进行消毒，可以使用多菌灵溶液灌根，控制病情的发展。
花毛茛的青霉病主要发生在种球的储藏期，生长期较少发生。染病的块根呈现暗褐色或黑色。严重的青霉病会在块根表面生长大量的青霉菌孢子。贮藏过程中，如果块根受到损伤或贮藏环境通风不良、湿度大，则容易发生青霉病，造成严重的危害。为了预防和治疗青霉病，应在采收、贮藏和分株繁殖等过程中尽量减少损伤，保护块根完好，并彻底消毒块根。在贮藏过程中，应调节贮藏场所的温度，增强通风，并降低湿度。定期检查并清理被青霉菌感染的块根，尽量避免感染其他块根。
花毛茛患上病毒病时，叶片会呈现皱缩不平的花叶、褪绿斑状，或者叶片萎缩变小、变厚。受害的花朵也会生长畸形，甚至无法开放。病情严重时，植株会明显矮化并最终死亡。为了预防和治疗病毒病，应加强栽培管理，合理施肥浇水，注意通风透光，使植株能够健康生长并提高抗病性。一旦发现受害植株，应立即清理。在病情初期，可以使用68%病毒可湿性粉剂800或1000倍液，进行喷洒3~5次。
花毛茛的根腐病主要发生在生长期间，如果土壤粘性重，碱性过大，或者环境低温且积水，会引发根腐病。根部在恶劣环境下感染病菌，导致根系腐烂并呈现黑褐色或黑色，地上茎叶也会逐渐枯黄死亡。为了预防和治疗根腐病，应在贮藏时严格剔除患病块根，然后将其浸泡在2%高锰酸钾溶液中15至30分钟，晾干后再进行贮藏，并注意贮藏场所的通风和降湿。在种植前，应彻底消毒培养土和块根，并适当进行浅栽。在生长期间，要注意控制水分，并及时松土。
花毛茛发生花叶病时，叶片上出现褪绿斑状症状，严重情况下，植株的生长发育不良。为了预防和治疗花叶病，通常是由于虫害引起的，所以应及时喷洒杀虫剂来治蚜。在修剪过程中，要注意工具的消毒，并及时处理修剪后的伤口，以免细菌感染。一旦发现病叶，应立即摘除。
