胡椒和花椒在叶子上有以下区别：胡椒的叶子较厚，接近革质，呈阔卵形至卵状长圆形，可能也存在接近圆形的叶子，长约10至15厘米，宽约5至9厘米。叶子的顶端短而尖锐，基部呈圆形，叶子两面均无绒毛，叶背上有约5至7条叶脉，叶柄长约1至2厘米。而花椒的叶子由5至13片小叶组成，这些小叶是对生的，没有叶柄，呈卵形或椭圆形，叶轴顶部可能有披针形的叶片。较大的叶片长约2至7厘米，宽约1至3.5厘米，叶子边缘有细裂齿。
两者在花朵上也有一些区别：胡椒的花序与叶对生，比叶子短或与叶子等长，总花梗与叶柄长度相同，苞片呈匙状长圆形，长约3至3.5厘米，顶端较宽且圆，形状类似浅杯。而花椒的花朵生长在顶端或侧枝的顶端，花被片有6至8片，呈黄绿色，大小基本相似。
最后，在果实上，胡椒的浆果呈球形，无柄，直径约3至4毫米，成熟时呈红色，未成熟时变黑干。而花椒的果实为红色，直径约4至5毫米，表面散布有微凸起的油点。
