卷丹百合的分株最好选择在早春二、三月，待土壤解冻后进行。将母株从花盆内取出时，应将多余的盆土抖掉，并尽可能将盘杂在一起的根系分开。同时，使用刀子将其剖成两株或多株，并确保每一株都带有相当数量的根系。叶片也需要适当修剪，以促进卷丹百合的成活率。
分株后的卷丹百合应进行消毒处理，可使用1500倍稀释的百菌清溶液浸泡分株的卷丹百合五分钟，然后晾干后即可上盆。还可以在上盆后立即用百菌清进行根部灌溉。
分株装盆后需进行浇水，但要注意控制水量，因为分株后的根系受到损伤，吸水能力较弱，所以需要大约3～4周才能恢复并发出新根。在这期间，要节制水量，以防根部烂烂。但是卷丹百合的叶片蒸腾功能不受影响，需要每天对叶面进行1～3次喷雾，以保持水分平衡。此期间不要施肥，避免暴晒，可将其放在遮荫棚内进行养护。
对于小苗的上盆或移栽，首先在盆底放入2厘米厚的陶粒或者粗粒基质作为滤水层，再撒上1～2厘米厚的腐熟有机肥料作为基肥，然后覆盖一层1～2厘米厚的基质，把植株放入，确保肥料与根系分开，避免烧根。上盆后需进行一次透水，并将其放置在稍微有荫蔽的环境中养护一周。
对于小苗的移栽，需要预先挖好种植穴，并在底部撒一层约4～6厘米厚的有机肥料作为底肥，然后覆盖一层土壤，将苗木放入，避免根部受损。放入苗木后，需将土壤回填，将根系覆盖住，并用脚将土壤踩实，最后进行一次透水浇灌。
