薰衣草叶斑病是一种病害，对一年生的播种苗和扦插苗来说，其症状表现为萎缩、失水、颜色变暗、枝条弯曲，严重时甚至导致根部枯萎腐烂，茎部导管变褐色。而三年生以上的苗子除了上述症状外，还表现为植株中心或边缘由内向外扩展的萎缩症状，枝条萎缩和死亡，最终导致整株植株死亡。
对于薰衣草叶斑病的防治，一种主要方法是进行2到3次波尔多液喷洒，配比为1:200。另一种方法是使用代森锌500~800倍液。
薰衣草根腐病的发生原因主要是由于春季薰衣草苗苗不返春或返春不好，导致干枯死亡；或者春季返春正常，但在开花初期，花束出现萎缩，不断落花直至全部脱落。此时，苗子的根茎部维管束会大量死亡。
预防薰衣草根腐病的方法有很多，其中包括选择地势平坦、排灌条件良好的土壤进行种植；在种苗时采集无病田苗枝条，并用甲基托布津或多菌灵处理；施用有机肥料；重视老枝和病枝的修剪；越冬前做好准备，将土壤均匀埋实；最重要的防治措施是使用70%甲基托布津可湿性粉剂400倍液或50%多菌灵可湿性粉剂500倍液进行叶面喷施。
薰衣草受红蜘蛛的害虫是一种螨虫，会食用叶片，导致叶片出现干黄的锈斑。防治红蜘蛛的方法主要包括及时处理枯枝落叶，清理环境以破坏叶螨的生存场所；采用正确的耕作方式，合理进行轮作，加强水肥管理；保护天敌，释放天敌来控制害虫的繁殖。另外，还有其他防治方法：在病害发生初期，可以使用0.26%苦参碱1000倍液均匀喷施，大面积发生时，可以使用20%三氯杀螨醇乳油1000~2000倍液或1.8%阿维菌素乳油3000~4000倍液均匀喷雾，效果较好。
叶蝉和跳甲是薰衣草常见的害虫，主要的防治方法包括使用50%辛硫磷乳油、50%杀螟松乳油、12%灭虫冠乳油等菊酯类药剂。
