地肤在生长过程中很少会遭受病害，不过还是可能受到虫害的影响。蚜虫是地肤常见的害虫之一，当发现蚜虫时，可以选择人工捕捉或者采用生物防治的方式进行驱虫。另外，也可以使用1000-1200倍稀释的40%乐果乳油喷雾来驱虫，或者使用500倍稀释的10%吡虫啉可湿性粉剂喷洒进行防治。
除了蚜虫，青虫也是地肤的常见害虫，在6月底至8月中旬比较多见。针对青虫的为害，可以人工除虫，或者使用药剂进行防治。可以选择40%乐果乳剂的1000-2000倍稀释液或20%定康颗粒剂的4000倍稀释液进行喷洒防治。
地肤也容易受到菟丝子等杂草的寄生。当发现地肤被菟丝子或其他杂草占据时，应及时进行清除和治理。清除杂草可以采取人工防治、机械防治、化学防治和生态防治等多种方法。人工防治主要包括仔细检查种子是否混入杂草种子以及手工拔除杂草。虽然这个过程较为费时费力，但是效果较好。化学防治主要是使用农药来除草。市场上有多种适用于地肤的除草剂可供选择，能够快速高效地除草，但要注意防止杂草再生和药物中毒情况的发生。
