三色堇的花朵比角堇大很多，通常是后者的两到三倍大小。一般来说，角堇的花朵约为2-4厘米，而三色堇的花朵大小在4-12厘米之间，大小差异明显。此外，三色堇的花朵呈现较圆的形状，而角堇的花朵则较为细长。
在花色方面，三色堇如其名，一般由三种颜色——黄色、蓝色和黑色组成。花朵中间有黑色的圆点，看起来像一个鬼脸，非常有趣。此外，三色堇的许多变种花朵中间也是黑色或深色，也有全黄色的。而角堇则多为浅色，并且中间没有深色的圆点，但会有像猫胡须一样的黑色直线。要判断是三色堇还是角堇，可以依据花朵中间的图案，花朵中间有黑色圆圈的是三色堇，而中间有黑线的则是角堇。
在生长习性方面，三色堇原产地在冰岛，对寒冷有较好的耐性，但不耐热。夏天生长不良，因此一般在秋天播种，在春天开花。而角堇原产地在欧洲，比三色堇更耐热，可以在秋天播种初夏开花，或春天播种秋季开花。三色堇的生长期为15-17周，而角堇的生长期为13-15周。
