在微型月季的开花期间，需要剪去花谢的花朵和下方的枝条，剪掉的长度应为8-12厘米。在春季发芽之前，还需要进行重剪，通常保留3-4个主枝，而每个主枝的基部需要留下3-5厘米的长度。
其次，及时剪除微型月季的残花是必要的，这样可以集中养分，促进更多的花朵和长时间的花期。如果不及时剪除残花，附近的一些腋芽容易萌发，从而产生弱枝。这不仅会消耗植株的养分，还会破坏植株的形状，开出的花朵也会变得畸形或者较小。
在第一批花朵开放之后，需要对中等枝条进行中截，保留3-4个芽；对于弱枝，需要进行较重的剪截，只保留1-2个芽；而对于强壮的枝条，剪截轻一些，保留大约5个芽，以适当抑制生长。第二次修剪需要严格控制，只需在残花下方的第二片叶的上方进行剪截，并保留第二片叶的腋芽。
在立秋之后，进行花后修剪时需要进行中截，每个枝条保留3-4个芽。为了保持植株形状的平衡，也可以退至上一批花开的枝条并进行剪截。同时，还需要剪除病枝、过密枝、过长枝和重叠的交叉枝。冬季修剪以整形为主，剪除生长不良的枯枝、病枝和交叉枝。对于生长茁壮且株型匀称的植株，一般剪去全株的三分之一。对于生长较弱的植株，可以剪去全株的三分之二，并保留3-4个较为强壮的主枝。
