两者在品种上存在一定的区别。南方红豆杉可以被戏称为曼地亚的”母亲”，因为曼地亚是南方红豆杉与欧洲红豆杉的杂交品种。除了这一点之外，它们在生长高度和其他方面也存在差异。南方红豆杉属于灌木，而曼地亚属于乔木。一般来说，南方红豆杉适合做生长周期较长的盆景，它的造型相对稳定。而曼地亚适合做生长周期较短的盆景，但需要经常修剪。
紫杉醇是两者之间另一个区别较大的方面。南方红豆杉的紫杉醇含量是曼地亚的四倍到十倍。在曼地亚中，紫杉醇主要集中在树皮中，提取量有限。而在南方红豆杉的各个部分都含有紫杉醇，不仅枝叶中含量丰富，根中的含量更是惊人。由于紫杉醇具有抗癌作用且价值较高，因此曼地亚受到了很多人的喜爱，并且其种植范围正在不断增加。
两者的生长速度也存在较大差异。南方红豆杉的生长速度相对较慢，一年大约长十多厘米。而曼地亚的生长速度比较快，一年可以长三十到五十厘米。因此，如果想要生长较快的红豆杉，可以选择曼地亚品种。
虽然两者都具有耐寒性，但程度有所不同。一般而言，南方红豆杉可以在零下二十五度的温度下保持健康，而曼地亚只能承受零下十五度的温度。总体而言，曼地亚可以被认为是更高配的选择，然而后者也有其自己的优点。
