马鞭草和鼠尾草是属于不同科和不同属的两种植物。根据前文，我们知道马鞭草属于马鞭草科的多年生直立草本植物，而鼠尾草属于唇形科的一年生草本芳香型植物。所以，它们在科属上存在一定的区别。
在形态上，马鞭草株型高大，比鼠尾草要高出两倍，叶片为单叶对生，形状呈卵形，表面有着茂密的绒毛。花序呈现穗状，而花朵通常是蓝紫色，常见的花冠形状为唇形，花丝较短，花果期稍早。而鼠尾草的树形是直立的，茎呈四棱形且少有或没有毛，花序则生在顶部，呈伞状或延长为总状花序或圆锥花序。鼠尾草的花朵颜色较淡，有淡红色、淡紫色、淡蓝色或白色。
从产地上看，马鞭草适应能力强，常见于倾斜山坡、高海拔路边以及林旁，分布广泛，几乎在世界各个温度带都能找到，我国大多数省份都可以见到。而鼠尾草则常生长于隐蔽的草丛或树荫下，我国主要分布在南方，北方较为罕见。
在药用价值上，马鞭草具有广泛的药用功效，主要有清热解毒、活血化瘀等作用，常用于治疗黄疸、痢疾、疟疾、淋病、水肿和牙疳等疾病，其药用价值很高。而鼠尾草则具有安神明目和缓解疼痛的功效，同时也被用于医院的消毒工作。
可以看出，马鞭草和鼠尾草在科属、形态、产地和药用价值等方面都存在明显的区别。这些区别使得它们在植物界中各有各的特点和应用价值。
