修剪沙漠玫瑰是一项极为重要的工作，如果不定期进行修剪，很容易造成观赏价值的丧失。花期结束后是最佳的修剪时机，可以根据个人喜好进行选择。适当的修剪可以保证沙漠玫瑰的植株形态更加美观，并增强其观赏性。
为了使沙漠玫瑰的树型更加优美，在小苗株高达到10cm左右时，应该剪除顶芽，促使其分枝。当枝条长出后，选择3~5根作为主枝，应该在不同方向上选择，并且要有一定的立体感，其余枝条都要剪除。当主枝长到一定高度时，需要进行短截，剩余高度取决于所需成形植株的规格。
在主枝生长出的分枝中，选择3~4根作为主侧枝，采取与主枝相同的方法进行保留和短截。随后，以主侧枝为基础，采取相同的方法逐级培养侧枝，进行大约4次的短截，分枝就可以达到要求。
如果希望在沙漠玫瑰的植株上嫁接其他优良品种，可以在短截后的主枝上进行嫁接。一旦嫁接成功的枝条成活，按照上述方法进行整形修剪。
