龟背竹常见的两种病害是灰斑病和锈病，主要危害它们的叶片，影响了植株的观赏价值。
灰斑病的症状表现在叶片上。病原菌从叶缘伤口进入，导致叶片形成灰褐色的病斑，边缘呈现黑褐色。随后，这些病斑融合成一片，最终腐烂枯死。受感染的叶片上会产生稀疏的黑色颗粒，这些颗粒是病原菌的分生孢子器。一旦发现叶片出现病斑，可以立即摘除并烧毁，以免病害传染给其他植株。在植株发病期间，可以使用70％甲基托布津1000倍液或50％多菌灵1000倍液喷洒杀菌。同时，也要注意防虫，因为虫害和病害同时发生，对植株的伤害更严重。
锈病初期症状表现为叶片两面出现针尖状的黄色小点，随后逐渐扩展成浅褐色或砖红色的疱斑，并散发出锈色粉末。轻度感染导致少量的锈色斑点，严重感染会覆盖整个叶片，导致叶片局部或整叶变黄枯萎，植株生长减弱。锈病不仅危害叶片，茎部也可能感染并产生类似叶片症状的病变。锈病在南方比较常见，尤其在植株摆放过密且湿度较大的情况下容易发病。防治锈病的方法包括加强植株的养护，及时清除患病的叶片。在病害初期可以喷施20％三唑酮乳油1500倍液或25％粉锈宁可湿性粉剂1500倍液，连续喷洒3~4次可以见效。
