一、叶子区别
树番茄的叶子排列方式是互生的，形状为卵形或卵状心形，长度约为5至15厘米，宽度约为5至10厘米。叶子的顶端逐渐变尖，基部稍微向一侧倾斜，并且有着深弯的缺口。叶子的边缘要么是完整的，要么呈微微波浪状。叶面的颜色是深绿色，背面则是淡绿色。叶柄长度为3至7厘米。
而番茄的叶子则呈现出羽状复叶或羽状深裂的形态，长度为10至40厘米。小叶数量不规则，通常为5至9枚，并且形状呈卵形或矩圆形，长度约为5至7厘米。小叶的边缘具有不规则的锯齿或裂片。
二、花朵区别
树番茄的花序生长方式为聚伞式，接近于叶腋生长或在叶腋之外生长，花梗的长度为1至2厘米。花萼呈辐状，直径约为6毫米，表面有短绒毛。花冠呈辐状，颜色为粉红色，直径在1.5至2厘米之间，有5个深裂的花瓣，裂片状如披针形。
而番茄的花朵则呈黄色，花冠也是辐状的，直径大约为2厘米左右，花萼裂片呈披针形。
三、果实区别
树番茄的果实呈卵状，果肉多汁液，长度约为5至7厘米，表面光滑，颜色为桔黄色或带有红色。
而番茄的果实则呈扁球形或近球形，果肉多汁液，颜色也是桔黄色或鲜红色，表面光滑。
