文山气候的特点是亚热带湿润季风气候。该地的地形复杂多样，所以气候类型也非常丰富，包括北热带、南亚热带、中亚热带、北亚热带、南温带和中温带等多种类型。文山地区的四季不明显，冬季并不十分寒冷，夏季也没有酷暑。干季和湿季的划分非常明显，每年的5-10月是雨季，11月到次年的4月是干季，降雨分布不均匀。该地气温变化不大，但日温差很大，因此无霜期相对较长。平均气温在12.0-23.1℃之间，积温在4500-7500℃以上。最冷的月份是1月，平均气温为6.5-13.5℃，而最热的月份是7月，平均气温为17.0-28.5℃。
根据文山的气候环境，适合生长的花卉植物种类很多。其中包括李花、梨花、向日葵、兰花、蝴蝶兰、鱼腥草、三七花、白玉兰、唐菖蒲、葱兰、水鬼蕉、晚香玉、大岩桐、六出花、洋水仙、大花葱、葡萄风信子、嘉兰、卷丹、网球花、小丽花、雪滴花、万年青、绿萝、吊兰、虎皮兰、忽地笑、紫叶酢浆草、铜钱草、花菖蒲、再力花、千屈菜、指甲兰、石斛兰、寒兰、蕙兰、卡特兰、大雪素、文心兰、口红花、飘香藤和千叶吊兰等。
文山的市花是三七花，原产于中国云南省文山州，该花是该地最具代表性的植物，具有独特的形态。而文山的市树则是拟单性木兰，该树是一种城市绿化中非常重要的树种，在文山广泛分布，生长良好，深受市民喜爱。
