玉溪位于亚热带季风气候区,地势高差悬殊,拥有独特的立体气候。该地气候温和,冬季并不寒冷,夏季也没有酷暑,年平均气温介于15.6℃至23.8℃之间。整年的气温变化不大,最炎热的月份为每年的七月,最寒冷的月份则是每年的一月。最热月与最冷月之间的平均温差约为10℃。阳光照射充足,年平均日照时数为2100至2300小时。降水量相对较少,年平均降水量约为800至950毫米,降雨日数大约为130至150天。
由于玉溪的气候条件适宜,大部分花卉植物在此都可以生长良好。比如,朱槿花、繁星花、胜红蓟、钓钟柳、秋海棠、红宝石喜林芋、琴叶喜林芋、绿宝石喜林芋、绿萝、唐菖蒲、香豌豆、文殊兰、朱顶红、美人蕉、百子莲、白兰、酒瓶兰、琴叶榕、橡皮树、一品红、含笑、栀子、球根海棠、半支莲、落地生根、红鹤芋、马蹄莲、网纹草、合果芋、黑叶芋、花叶万年青、虎斑凤梨、鹤望兰、虎刺梅、金边虎尾兰、龙须海、昙花、虎耳草、三角梅、米兰、茉莉、扶桑、龟背竹、伞草、荷花、睡莲、蝴蝶兰、万带兰等花卉品种,在这里都可进行栽培。
玉溪市的市花是朱槿花,其造型美观,因大气候适合其生长,受到当地居民的喜爱。市树还未确定。