肽键是通过氨基酸的α-羧基和α-氨基进行脱水缩合形成的酰胺键，化学式为-CO-NH-。多肽链由氨基酸通过肽键联结而成，并且肽键比较稳定。氨基酸通过肽键连接形成的产物称为肽，最简单的肽是由两个氨基酸残基形成的，称为二肽。在肽中，氨基酸不再是游离的形态，而是成为氨基酸残基。一条多肽链的一端含有一个游离的氨基，另一端含有一个游离的羧基。因此，一条肽链中形成的肽键数比氨基酸分子数少一个。每两个氨基酸分子间进行一次氨基酸脱水缩合反应，就形成一个肽键，并且会失去一个水分子。所以，肽键数等于氨基酸数减去形成的肽链数。
