站在这里等你三千年的歌词含义是陪伴守望着孤坟，度过孤独的一生。王琪作为歌曲的作者，以胡杨林和雁的传说为基础，创造了一对虚拟的男女主角。这对恋人分别生活在梅里雪山两侧的草原上，他们发誓海枯石烂，永不分离。然而，女主角患上了无法治愈的疾病，她觉得应该让男主角放弃她，并与父母商量好，以一种善意的谎言欺骗男主角，告诉他她会另爱他人并远嫁异乡，并告知了出嫁的日期。女主角穿上嫁衣，在父母的扶持下含泪走上花轿，她在花轿中看着男主角渐行渐远，情不自禁地流泪呼喊着“不要等我了”。当走到男主角看不见的地方时，女主角下了花轿，心痛欲绝……不久，女主角在痛苦中离世。男主角一直在思念中等待着，直到六年后才得知真相，他来到女主角的坟前，哭泣并发誓，生也愿意等你，死也愿意等你，愿意像胡杨一样等待三千年，为了不让女主角孤独，他将陪伴守望着她的孤坟，度过孤独的一生。
