《火影忍者》第468集和第469集中发生了九尾入侵木叶的事件。九尾是整个故事的开端，直到鸣人的母亲向他讲述了16年前的经历，这一场景才完全展现给观众。鸣人的父亲是九尾的牺牲品，而鸣人的命运也因此而改变。
在古代，存在着一棵神树，它的查克拉被夺走后，变成了破坏力极强的十尾。为了阻止十尾继续造恶，六道仙人将其封印，并将十尾的查克拉分为九份，形成了九只尾兽，其中九尾是最为强大的一只。
六道仙人逝世后，九尾破坏了许多村庄，使人们失去了家园。后来，宇智波斑收服了九尾，并由初代火影的妻子漩涡水户将九尾封印在自己的身体内。然而，在漩涡玖辛奈分娩时，一个神秘的面具男打开了封印，释放出了九尾。
这个面具男就是宇智波带土，他释放九尾是为了让九尾继续威胁人间，以实现他隐秘的目的。当时，火影的职位已传给波风水门，他是第四代火影，也是鸣人的父亲。他将九尾封印在了鸣人的体内，自己则在使用尸鬼封尽之后牺牲了。
年幼的鸣人失去了父母，还因为体内封印了九尾而受到了他人的排斥。在成长过程中，鸣人多次因无法控制九尾的力量而兽化，他与九尾一直是对立的关系。然而，随着时间的推移，他们逐渐理解对方，在相处中建立了友谊。
最终，鸣人和九尾成为了好朋友，在九尾的帮助下，鸣人成为了完美的人柱力。在与佐助的决战中，九尾将自己的所有查克拉都交给了鸣人，并沉睡了下去。然而，在剧场版中，九尾成功苏醒，并恢复了以往的力量。
