海鲜中的丰富钙质与柠檬中的果酸可能会发生反应，导致蛋白质凝固或钙质吸收不良，可能造成肠胃不适或增加结石的风险。同样地，柠檬与牛奶的搭配也会导致果酸与牛奶中的蛋白质和钙质相互作用，导致营养物质吸收不良，影响肠胃消化，增加肠胃负担。
此外，柠檬中富含丰富的维C，当与含有抗维C物质的食品一同食用时，会降低食品的营养价值。例如，含有抗坏血酸酵酶的胡萝卜、含有溶维C酶的黄瓜以及含有维C氧化剂的动物肝脏等食品。
然而，柠檬与一些食物的搭配是合适的。鸡肉、芦荟和甘蔗汁与柠檬可以一同使用，这样可以发挥出更好的效果。
