克州,位于新疆维吾尔自治区的西南部,地理位置横跨天山山脉西南部、帕米尔高原东部、昆仑山北坡和塔里木盆地西北缘。它与吉尔吉斯斯坦和塔吉克斯坦两国接壤,边境线长达1195千米。与阿克苏地区相连于东部,与喀什地区毗邻于南部。克州的东西长约500千米,南北宽约140千米,总面积为7.25万平方千米。
克孜勒苏柯尔克孜自治地处塔里木河流域上游,地理范围横跨天山山区、帕米尔高原、昆仑山山区以及塔里木盆地边缘。全州90%以上为山地,谷地和盆地分布于山间,呈现典型的温带大陆性气候。这里阳光充足,雨量稀少,因此被誉为瓜果之乡。