从2015年3月开始，海员可以个人身份申办海员证。然而，大多数海员仍然选择通过单位办理海员证，这导致了一定的费用产生，最少需要支付200元。如果海员个人办理海员证，有些海事局要求户口所在地的派出所出具无犯罪证明，这会增加时间和交通成本。此外，办理海员证（换发新证）时必须同时拥有有效的健康证书。由于海员的健康证书有效期为两年，经常会出现健康证书失效的情况，此时海员需要提前进行体检以更换海员证。由于当前航运形势不佳，等到需要上船的时候，海员的健康证书有效期往往不足合同期的时间（即6～8个月），因此海员需要重新体检，这使得更换海员证变得复杂且涉及费用。
