宋朝之后,出现了元朝。元朝是中国历史上由蒙古族所建立的一个统一帝国,首都设在大都(今北京)。元朝的建立始于1271年,当时忽必烈取了《易经》中的“大哉乾元”之意,将国号改为大元。在接下来的时期,元朝相继征服了金朝、西夏、大理等政权,最终在1276年攻占了临安,南宋灭亡。至1279年经过崖山海战,元朝消灭了南宋残余势力,实现了中国的完全统一,结束了自五代十国以来的分裂局面。
元朝的疆域十分广阔,北至北海,东到日本海,并在澎湖列岛设立了巡检司。在行政上,元朝采用一省制,在中央设有中书省,由左右丞相和平章政事处理政务。在地方方面,则实行行省制度,这是对中国行省制度的先驱。元朝的商品经济和海外贸易相对繁荣,尽管整体生产力不如宋朝,但在这个时期,元曲和散曲等文化形式也相继出现。
元朝成立后不断扩张领土,但在对日本和东南亚诸国的海外征伐中屡次失败,特别是在元日战争中的战败。中期以后,元朝的皇位更迭频繁,政治一直未能稳定发展,虽然经济有所增长,但未能恢复到宋朝时期的水平。后期的统治日益腐败,宰相专权和内乱屡屡发生,民族矛盾也日益加深,从而导致了大规模的农民起义的爆发。