二本大学学费在不同省份、地区有所不同。经济发达的省份，学费大约在6000元左右，而经济发展水平较差的地区，学费则约为3600元左右。此外，城市和专业的不同也会导致二本大学学费的差异。公立大学一般收费在4000至6000元间，中外合作办校或者中外合作办学的专业学费在15000至50000元之间，极少数的学费甚至超过50000元，而私立大学或独立学院的学费则在10000至50000元之间。专业院校的学费一般在10000元以上，还有一些极少数学费在80000至100000元之间，例如北京师范大学与香港浸会大学的合作办学项目以及上海纽约大学。在一线城市的二本大学中，以上海中医药大学为例，学费标准为一般专业每生每学年5000元，而特殊（热门）专业每生每学年6500元。药学（中英合作）专业（为热门专业）的学费为每生每学年19000元，护理（中英合作）专业（为热门专业）的学费为每生每学年18000元。
