南航明珠会员卡对于常常乘飞机的乘客来说非常有利，因为可以积累航空里程，并在累积到一定程度后兑换免费航班，这是最大的优势。每次乘坐南航航班都可以积累里程，但并非所有舱位都能积累里程。南航规定了几个指定仓位是不能积累里程的，而积累的里程可以用来兑换免费机票或升舱。另外，乘坐南航航班累计20个航段可以升级为南航银卡，40个航段可以升级为南航金卡。南航金卡会员可以免费使用南航休息室，而对于没有南航休息室的机场，由于南航是天合联盟成员航空公司，拥有南航金卡的旅客可以在世界上任何一个天合联盟成员航空公司的休息室和贵宾室免费使用。只要在南航网站上购买世界上任何一家天合联盟成员航空公司的机票，并且选择指定的舱位，里程就可以积累到南航的里程卡上。此外，南航金卡和银卡会员还可以享受免费升级托运行李的待遇，银卡会员限额为30公斤，金卡会员限额为40公斤。当南航航班超售时，金卡和银卡会员还可以享受候补待遇。
